Publications

2021 year

    （Original paper）
  1. Otomi Cho, Mizuki Unno, Keita Aoki, Masako Takashima, Takashi Sugita. 2022. Malassezia display a hyphae-like "spaghetti and meatballs" configuration in keratotic plugs. Med. Mycol. J. 63, 81-84.
    （Review）
  1. Yurkov, A., Alves, A., Bai, F.Y., Boundy-Mills, K., Buzzini, P., Čadež, N., Cardinali, G., Casaregola, S., Chaturvedi, V., Collin, V., Fell, J.W., Girard, V., Groenewald, M., Hagen, F., Hittinger, C.T., Kachalkin, A.V., Kostrzewa, M., Kouvelis, V., Libkind, D., Liu, X., Maier, T., Meyer, W., Péter, G., Piątek, M., Robert, V., Rosa, C.A., Sampaio, J.P., Sipiczki, M., Stadler, M., Sugita, T., Sugiyama, J., Takagi, H., Takashima, M., Turchetti, B., Wang, Q.M. and Boekhout, T. 2021. Nomenclatural issues concerning cultured yeasts and other fungi: why it is important to avoid unneeded name changes. IMA Fungus 12: 18.
  2. 高島昌子. 酵母の同定：種の同定と種内の同定, 日本醸造協会誌　116, 674-680. 2021.
  3. 高島昌子、杉田隆. 酵母の多様性獲得の仕組みの解明、NGRCニュース　No.12, 63-64, 2021.
  4. 高島昌子、青木敬太、田中尚人、大熊盛也. Sporidiobolales目酵母の再分類：ドラフトゲノムデータに基づく系統関係の解明および表現型の探索、NGRCニュース　No.13, 68-69, 2021.
    （Conference presentation）
  1. 高島昌子．菌名を決めるための3つの要素．第65回日本医真菌学会総会・学術集会／真菌症フォーラム2021，シンポジウム 4　病原真菌分類の未来に向けて，10月29〜30日, 第一ホテル東京（ハイブリッド開催）口頭発表.
  2. 杉田隆、高島昌子.　病原性酵母の分類の現状.　第65回日本医真菌学会総会・学術集会／真菌症フォーラム2021，シンポジウム 4　病原真菌分類の未来に向けて，10月29〜30日, 第一ホテル東京（ハイブリッド開催）口頭発表.
  3. 青木敬太、雪真弘、大熊盛也、眞鍋理一郎、杉田隆、田中尚人、高島昌子. 担子菌酵母の多様性を表す新規核表現型の研究.　第44回日本分子生物学会年会 2021, ポスター発表, 12月1日〜3日, パシフィコ横浜（ハイブリッド開催）ポスター発表.
  4. 栢森綺音、青木敬太、志波優、藤田信之、杉田隆、高島昌子、田中尚人.　比較ゲノムによるCutaneotrichosporon cavernicolaの交配遺伝子座の解析.　日本農芸化学会2022年度大会、2022年3月16日（オンライン開催）口頭発表.

2022 year

    （Review）
  1. Takashima and Sugita. 2022. Taxonomy of pathogenic yeasts Candida, Cryptococcus, Malassezia, and Trichosporon: Current status, future perspectives, and proposal for transfer of six Candida species to the genus Nakaseomyces. Med. Mycol. J. 63, 119-132.
    （Conference presentation）
  1. Masako Takashima, Ri-ichiroh Manabe, Keita Aoki, Masahiro Yuki, Naoto Tanaka, Takashi Sugita, and Moriya Ohkuma. 「Investigation of the orthologs that characterize Ascomycota and Basidiomycota.」 ISSY36, 12-15 July, 2022. UBC Vancouver, Canada. Oral presentation.
  2. Keita Aoki, Ri-ichiroh Manabe, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Naoto Tanaka, and Masako Takashima. 「Hyphal growth of Trichosporon asahii is accelerated by the addition of magnesium.」 ISSY36, 12-15 July, 2022. UBC Vancouver, Canada. Poster presentation.
  3. 青木敬太、眞鍋理一郎、大熊盛也、杉田隆、田中尚人、高島昌子.「マグネシウムの添加は、Trichosporon asahiiの菌糸の初期生長を早める」第66回日本医真菌学会2022、10月1〜2日、長良川国際会議場　口頭発表.
  4. 青木敬太、松谷峰之介、山本絋輔、眞鍋理一郎、大熊盛也、杉田隆、田中尚人、高島昌子.「Trichosporon asahiiの菌糸の初期生長に関わる因子群の解析」第45回日本分子生物学会年会、11月30〜12月2日、幕張メッセ　ポスター発表.
  5. 小林裕樹、栢森綺音、青木敬太、志波優、藤田信之、杉田隆、田中尚人、高島昌子.「ゲノム情報に基づいた担子菌酵母Cutaneotrichosporon cavernicolaの種分化の解析」日本農芸化学会2023年度大会、3月14〜17日、オンライン開催、口頭発表.

2023 year

    （Original paper）
  1. Keita Aoki, Kosuke Yamamoto, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Naoto Tanaka, and Masako Takashima. 2023. Hyphal growth in Trichosporon asahii is accelerated by the addition of magnesium. Microbiology Spectrum Jun 15; 11(3): e0424222. doi: 10.1128/spectrum.04242-22.
  2. M. Groenewald, C.T. Hittinger, K. Bensch, D.A. Opulente, X.-X. Shen, Y. Li, C. Liu, A.L. LaBella, X. Zhou, S. Limtong, S. Jindamorakot, P. Gonçalves, V. Robert, K.H. Wolfe, C.A. Rosa, T. Boekhout, N. Čadež, G. Péter, J.P. Sampaio, M.-A. Lachance, A.M. Yurkov, H.-M. Daniel, M. Takashima, K. Boundy-Mills, D. Libkind, K. Aoki, T. Sugita, A. Rokas. 2023. A genome-informed higher rank classification of the biotechnologically important fungal subphylum Saccharomycotina. Studies in Mycology 105: 181-202.
  3. Yuuki Kobayashi, Ayane Kayamori, Keita Aoki, Yuh Shiwa, Minenosuke Matsutani, Nobuyuki Fujita, Takashi Sugita, Wataru Iwasaki, Naoto Tanaka, Masako Takashima. 2023. Chromosome-level genome assemblies of Cutaneotrichosporon spp. (Trichosporonales, Basidiomycota) reveal imbalanced evolution between nucleotide sequences and chromosome synteny. BMC Genomics in press.
    （Review）
  1. 青木敬太、小林裕樹、高島昌子.　微生物資源の整備と利活用の戦略「第2節　真菌の命名と系統分類に関する課題」大熊盛也先生監修　NTS
    （Conference presentation）
  1. 小林裕樹、栢森綺音、青木敬太、志波優、藤田信之、杉田隆、岩崎渉、田中尚人、高島昌子.「担子菌酵母Cutaneotrichosporon cavernicolaにみる塩基配列と染色体構造の変異速度」日本菌学会第67回大会、5月27〜28日、口頭発表.
  2. 青木敬太，山本紘輔，大熊盛也，杉田隆，田中尚人，高島昌子.「マグネシウムの添加によって伸長するTrichosporon asahiiの菌糸と細胞小器官の動態変化」日本微生物資源学会第29回大会、6月21〜23日、口頭発表.
  3. 青木敬太，山本紘輔，大熊盛也，杉田隆，田中尚人，高島昌子.「マグネシウムの添加により誘導されるTrichosporon asahiiの菌糸生長」第67回日本医真菌学会、10月6〜7日、口頭発表.
  4. Masako Takashima, Ri-ichiroh Manabe, Keita Aoki, Masahiro Yuki, Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, Takashi Sugita, and Moriya Ohkuma. 「Investigation of characteristic orthologs of Ascomycota and Basidiomycota: insights from principal coordinate analysis.」ISSY37, 27 Nov-1 Dec, 2023. National Wine Centre, Adelaide, Australia. Poster presentation.
  5. Keita Aoki, Minenosuke Matsutani, Kosuke Yamamoto, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Naoto Tanaka, and Masako Takashima. 「Hyphal growth in Trichosporon asahii is induced by the addition of magnesium.」ISSY37, 27 Nov-1 Dec, 2023. National Wine Centre, Adelaide, Australia. Poster presentation.
  6. Yuuki Kobayashi, Ayane Kayamori, Keita Aoki, Yuh Shiwa, Minenosuke Matsutani, Nobuyuki Fujita, Takashi Sugita, Wataru Iwasaki, Moriya Ohkuma, Naoto Tanaka, and Masako Takashima.「Intrageneric genomic relationship and evolution of non-model Basidiomycota yeasts based on chromosome-level genome assemblies」ISSY37, 27 Nov-1 Dec, 2023. National Wine Centre, Adelaide, Australia. Oral presentation.
  7. 青木敬太、松谷峰之介、大熊盛也、杉田隆、田中尚人、高島昌子.「マグネシウムの添加により促進するTrichosporon asahiiの菌糸生長と遺伝子発現」第46回日本分子生物学会年会、12月6〜12月8日、神戸ポートアイランド　ポスター発表.
  8. 小林裕樹、栢森綺音、青木敬太、志波優、松谷峰之介、藤田信之、杉田隆、岩崎渉、大熊盛也、田中尚人、高島昌子.「全ゲノム情報に基づいた担子菌酵母の変異と種分化の解析」第46回日本分子生物学会年会、12月6〜12月8日、神戸ポートアイランド　ポスター発表.
  9. 小林裕樹、田中尚人、松谷峰之介、黒川祐奈、青木敬太、大熊盛也、高島昌子.「全ゲノムデータに基づくスポリディオボラス目酵母の系統進化解析」第18回日本ゲノム微生物学会年会、3月12日〜14日、かずさアカデミアホール　ポスター発表.

2024 year

    （Conference presentation）
  1. 小林裕樹、田中尚人、松谷峰之介、黒川祐奈、青木敬太、大熊盛也、高島昌子.「全ゲノムデータに基づくスポリディオボラス目酵母の系統解析」日本菌学会第68回大会、5月17日〜19日、八戸ポータルミュージアム　ポスター発表.
  2. 青木敬太「酵母の二形性研究から多様性研究へ」第25回新産業酵母研究会講演会、5月17日、産総研臨海副都心センター　口頭発表.
  3. 高島昌子「酵母国際シンポジウムISSY37の参加報告」第25回新産業酵母研究会講演会、5月17日、産総研臨海副都心センター　口頭発表.
  4. 青木敬太、大熊盛也、杉田隆、小林裕樹、田中尚人、高島昌子.「蛍光顕微鏡観察に基づいたトリコスポロン酵母の種間多様性解析」日本微生物資源学会第30回大会、7月3〜5日、木更津市金田地域交流センター、ポスター発表
  5. Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, Minenosuke Matsutani, Yuuna Kurokawa, Keita Aoki, Moriya Ohkuma, Ayane Kayamori, Yuh Shiwa, Nobuyuki Fujita, Takashi Sugita, Wataru Iwasaki, and Masako Takashima.「Genome-based systematics and diversity analyses of basidiomycete yeasts」IMC12, 11-15 Aug, 2024, Maastricht, Netherlands. Poster presentation.
  6. Keita Aoki, Minenosuke Matsutani, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, and Masako Takashima. 「Transition from hyphae to arthroconidia requires a nucleolar protein NOP14 ortholog in Trichosporon asahii」ICY16, 29 Sep-3 Oct, Cape Town, South Africa. Poster presentation.
  7. Keita Aoki, Minenosuke Matsutani, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, and Masako Takashima. 「Dimorphic transition between yeast, hypha, and arthroconidia morphologies by Trichosporon asahii」APSMM2024, 6-9 Nov, Kyoto. Oral presentation.
  8. Yuuki Kobayashi 「Diversity in Yeast Genomes」APSMM2024, 6-9 Nov, Kyoto. Oral presentation.
  9. Masako Takashima, Ri-ichiroh Manabe, Keita Aoki, Masahiro Yuki, Yuuki Kobayashi, Takashi Sugita, Moriya Ohkuma, and Naoto Tanaka. 「New fungal taxonomy from a genomic perspective」APSMM2024, 6-9 Nov, Kyoto. Oral presentation.
  10. 青木敬太、大熊盛也、杉田隆、小林裕樹、田中尚人、高島昌子.「蛍光顕微鏡観察によって明らかになるトリコスポロン酵母の性状」第68回日本医真菌学会総会・学術集会、11月6日〜9日、国立京都国際会館、口頭発表
  11. 小林裕樹「ロングリードシーケンサーを用いた全ゲノム解析から真菌の多様性と進化を探る」第68回日本医真菌学会総会・学術集会、11月6日〜9日、国立京都国際会館、口頭発表
  12. 高島昌子、杉田隆「ゲノム情報から分類することは妥当か？」第68回日本医真菌学会総会・学術集会、11月6日〜9日、国立京都国際会館、口頭発表
  13. 青木敬太、松谷峰之介、大熊盛也、杉田隆、小林裕樹、田中尚人、高島昌子.「担子菌酵母Trichosporon asahiiのニ形性に関与する遺伝子機能の研究」第47回日本分子生物学会年会、11月26日〜29日、福岡国際会議場•マリンメッセ福岡、ポスター発表
  14. 小林裕樹、青木敬太、志波優、杉山純多、田中尚人、高島昌子.「子嚢菌酵母Saitoella coloradoensisおよびSavitreella phatthalungensisの全ゲノム解析」第47回日本分子生物学会年会、11月26日〜29日、福岡国際会議場•マリンメッセ福岡、ポスター発表
  15. 高島昌子.「分類学は基礎と応用の橋渡しを担う」2024年東京農業大学総合研究所応用微生物部会シンポジウム「ゲノムデータがもたらす酵母・醸造の研究の発展」12月13日、榎本ホール、東京農業大学