ClustalWの出力結果の解釈のしかた
下の6種類の生物種間におけるRNA polymeraseの相同性を例に
pir_A32618 (human)
pir_T51950 (Arabidopsis)
CELH27MO9 (C. elegans)
S59774 (Saccharomyces)
AE003828 (Drospphila)
AK015823 (mouse)
上の6種類は、pir_A32618をBLAST検索にかけて得られた結果から引用している。このうち、pirは蛋白質(アミノ酸配列)のデータベースから、そのほかは塩基配列のデータベースからの引用である。塩基配列のデータベースには、翻訳したアミノ酸配列も載っている。アミノ酸と塩基のアルファベットを混同しないように。
| 記号 | 意味 |
| * | すべての遺伝子(蛋白質)で同一(保存されている) |
| : | アミノ酸の性質が同じである |
| . | アミノ酸の性質が似ている |
| 無印 | 保存されていない |
| - | 対応するアミノ酸が無い |
アラインメントは下の段ほど、相同性が低くなるようにならぶ
| 遺伝子 | 出力結果 |
| 6種すべて |  |
| yeastを除 |  |
| Arabidoを除 |  |
| elegansを除 |  |
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