分子擬態：molecular mimicry 〜形を見て初めてわかった〜

翻訳伸長反応とトランスロケーション（転位）

伸長反応は下図のようなステップで進む。

すなわち、

• 伸長因子EF-Tu (elongaion factor)がアミノアシルtRNAをリボソーム上のA 部位に運んでくる。
• ペプチジル反応によりP部位のtRNAからペプチド鎖がA部位のtRNAに転移される。
• ペプチド鎖のついたA部位のtRNAがP部位のtRNAを追い出してP部位にはいる（転位反応）。このときにEF-Gが必要である。

答えを見る前に、自分で構造を見てみよう。

• EF-Tu-tRNA複合体の構造ファイルをダウンロードする。次にEF-Gの構造ファイルをダウンロードする。
• Raswinを起動しEF-Tu+tRNAの構造ファイル(1ttt(PhetRNA-EFtu).pdb)を開く。(Fileメニューからopenを選択)
• デスクトップ画面の下辺にあるメニューバーからCommand Line windowをクリック。
  >select all
  >spacefill
  >color cyan
  >color chain
  >select gnp
  >color magenta
  この形と、次のEF-Gの形を比べてみる。

  次にEF-Gの構造ファイル(1DAR(EF-G).pdb)をひらく。
  >select all
  >spacefill
  >color cyan
  >select gdp
  >color magenta
  

  Shiftキーを押しながら、左ボタンを押しながらマウスを動かすと分子モデルの拡大・縮小ができる。

  ＜問題＞さて二つの構造を比べて何がわかっただろうか。

  EF-Tu+tRNAの構造とEF-Gの構造は非常に似ていた。これは、EF-GがEF-Tu+tRNAの形を擬態していると考えられる。すなわち、EF-Tuに結合したtRNAはリボソームのA部位に結合する。これは、A部位がtRNAとちょうどフィットする形になっていると考えられる。EF-Gが擬態をすることでA部位にはまりこみ転位を進めていることが予想される。

  擬態は、生物界ではよく見られる現象である。昆虫でも、葉にそっくりな蝶や、枝にそっくりな虫、カメレオンの体色変化も擬態の一種である。
  EF-GはtRNAの形をタンパク質でまねることにより、リボソームをだまして結合していることになる。

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