分子を見る目：MHCとT細胞受容体を例に

MHCとは

たとえば、Class I MHCは細胞内のプロテアーゼ（プロテアソーム）により作られた９アミノ酸からなるペプチドと複合体を作り、細胞の外側にそれを突き出すことにより、別の細胞（Ｔ細胞）により認識してもらうことが仕事である。T細胞側でMHCとペプチド複合体を見る目の役割を果たしているのはT 細胞受容体である。この目が自己・非自己を見分けている。
免疫の基礎の基礎

• class I MHCとペプチド複合体の構造ファイルをダウンロードする。Class I MHCとペプチドとT細胞受容体複合体の構造ファイルをダウンロードする。
  ちらっと答えを見る。
• Raswinを起動しMHCとペプチド複合体の構造ファイル(1A9E(Mhc+pep).pdb)を開く。(Fileメニューからopenを選択)
• デスクトップ画面の下辺にあるメニューバーからCommand Line windowをクリック。
  >select amino
  >wireframe off
  >backbone 60
  　（backbone よりcartoonの方が見た目にわかりやすいかもしれない)
  >color chain
  （Class I MHCは２本の鎖から構成されている。ペプチドがちょうど手のひらの上に乗るようにMHC分子と複合体を作っている。）

  次にMHCとペプチドとT細胞受容体複合体の構造ファイル(1BD2(Mhc+Tcr).pdb)をひらく。
  >select amino
  >wireframe off
  >backbone 40 （あるいはcartoonでも）
  >color structure
  

  ＜問題＞ Ｔ細胞受容体のMHC認識部分のドメインの構造は何かに似ていないだろうか。

Shiftキーを押しながら、左ボタンを押しながらマウスを動かすと分子モデルの拡大・縮小ができる。